[Seqan-dev] Allgemeine Scores verwenden?
- From: Robert Steinfelder <rsteinfelder@uni-bielefeld.de>
- To: seqan-dev@lists.fu-berlin.de
- Date: Thu, 20 Aug 2009 15:57:41 +0200
- Organization: University of Bielefeld
- Subject: [Seqan-dev] Allgemeine Scores verwenden?
Hallo, ich habe einen Algorithmus in SeqAn implementiert. Dieser soll anhand einer ScoreMatrix, einem Alignment und einer Sequenz einen Ähnlichkeitsscore zurückliefern. Derzeit funktioniert dieser aber nur mit einfachen Scores (Mis-/Match, GapOpen, GapExtension), aber nicht mit z.B. einer Blosum62. Wie kann man allgemein mit komplexeren Scores arbeiten? Gruß, Robert Steinfelder
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