[Seqan-dev] Allgemeine Scores verwenden?

From: Robert Steinfelder &lt; rsteinfelder@uni-bielefeld.de &gt;
To: seqan-dev@lists.fu-berlin.de
Date: Thu, 20 Aug 2009 15:57:41 +0200
Organization: University of Bielefeld
Subject: [Seqan-dev] Allgemeine Scores verwenden?

Robert Steinfelder <rsteinfelder@uni-bielefeld.de> · Thu, 20 Aug 2009 15:57:41 +0200

Hallo,

ich habe einen Algorithmus in SeqAn implementiert. Dieser soll anhand einer 
ScoreMatrix, einem Alignment und einer Sequenz einen Ähnlichkeitsscore 
zurückliefern. Derzeit funktioniert dieser aber nur mit einfachen Scores 
(Mis-/Match, GapOpen, GapExtension), aber nicht mit z.B. einer Blosum62.

Wie kann man allgemein mit komplexeren Scores arbeiten?

Gruß, 
Robert Steinfelder