Re: [Seqan-dev] Scoring mit Blosum62

[David Weese <weese@inf.fu-berlin.de>]

Mmh, keine Ahnung. So seh ich noch nichts falsches.

David

> Ansonsten habe ich noch ein kleineres Compile-Problem gerade, was 
> irgendwie nicht sehr verständlich ist. Ich hab bei dem 
> Vergleichsoperator noch einen Vergleich eingebaut um nach e-Value zu 
> sortieren, siehe unten. Dazu bekomme ich:
>
> razers_withBlast.h:631: error: `.' cannot appear in a constant-
> expression
> razers_withBlast.h:631: error: parse error in template argument list
>
> Danke!
>
> Gruß,
> Hannes
>
>
>
> template <typename TReadMatch>
> struct LessRNoGPos : public ::std::binary_function < TReadMatch, 
> TReadMatch, bool >
> {
>    inline bool operator() (TReadMatch const &a, TReadMatch const &b) 
> const
>    {
> 	// read number
> 	if (a.rseqNo < b.rseqNo) return true;
> 	if (a.rseqNo > b.rseqNo) return false;
>
> 	#ifdef RAZERS_BLAST
>         // evalue
>         if (a.eValue < b.eValue) return true;
>         if (a.eValue > b.eValue) return false;
> 	#endif
> 	// genome position and orientation
> 	if (a.gseqNo < b.gseqNo) return true;
> 	if (a.gseqNo > b.gseqNo) return false;
> 	if (a.gBegin < b.gBegin) return true;
> 	if (a.gBegin > b.gBegin) return false;
> 	if (a.orientation < b.orientation) return true;
> 	if (a.orientation > b.orientation) return false;
> 	// quality
> 	#ifdef RAZERS_MATEPAIRS
> 	return a.pairScore > b.pairScore;
> 	#else
> 	return a.editDist < b.editDist;
> 	#endif
>    }
> };
>
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